時空組學研究前沿進展【第6期】

亞細胞級別分辨率的細胞分割算法

期刊： Nature Methods

IF：48

時間：2023年7月

全文：http://c18.com.cn/wp-content/uploads/2023/08/unnamed-file-4.pdf

作者開發(fā)了命名為亞細胞空轉細胞分割技術的算法：SCS。該算法相比其他分割算法更為準確地識別每個細胞的位置，并能標注其細胞類型。還能進一步提供有關細胞內(nèi)RNA分子的亞細胞定位的信息。從而使研究人員能夠深入探究細胞在組織內(nèi)的活動。

單細胞技術解析靈長類脊髓損傷修復機制

期刊：Nature Communication

IF：16.6

時間：2023年8月

全文：http://c18.com.cn/wp-content/uploads/2023/08/unnamed-file-5.pdf

作者通過對構建的胸段全橫斷脊髓損傷恒河猴模型進行了單細胞轉錄組測序，深入解析了完全性脊髓損傷近端和遠端不同區(qū)域的細胞動態(tài)變化。并進一步研究了膠原材料支架移植對完全性脊髓損傷不同區(qū)域的治療效應和機制。

同時檢測轉錄水平與Hi-C的單細胞多組學技術

期刊：Nature Structural & Molecular Biology

IF：16.8

時間：2023年8月

全文：http://c18.com.cn/wp-content/uploads/2023/08/hicmrna.pdf

作者建立了能實現(xiàn)了在單個細胞中同時檢測染色質三維結構（Hi-C）和轉錄表達的單細胞多組學技術方法——scCARE-seq。并利用小鼠胚胎干細胞中驗證了該方法的效果。結果表明，此方法優(yōu)化了單細胞Hi-C聚類結果，矯正了細胞周期的干擾，進一步促進Hi-C與轉錄之間動態(tài)調(diào)控關系的研究。